La presidencia será anual y rotatoria entre los Grupos Parlamentarios y comenzará a ser ejercida por la senadora del PRI, Claudia Ruiz Massieu Salinas.
El acuerdo también establece que, para el cumplimiento de su objetivo, la Comisión se ceñirá a las reglas de funcionamiento de las comisiones ordinarias y tendrá las atribuciones conferidas a dichas comisiones para solicitar información, celebrar reuniones de trabajo de carácter interno con servidores públicos de los países suscriptores del T-MEC.
La Comisión deberá presentar informes de sus trabajos ante la Junta de Coordinación Política del Senado de la República cada que le sean requeridos por ese órgano de gobierno, además de aquellos que deberá rendir por disposición del Reglamento del Senado de la República.